148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1127 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
333 aa  682    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  77.99 
 
 
259 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  48.8 
 
 
330 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.4 
 
 
330 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  48.96 
 
 
326 aa  325  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  47.6 
 
 
326 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.5 
 
 
330 aa  317  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.8 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  44.31 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  44.31 
 
 
333 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.98 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.81 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  43.05 
 
 
384 aa  298  8e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  45.21 
 
 
330 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  43.11 
 
 
333 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  44.18 
 
 
331 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.18 
 
 
327 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.28 
 
 
331 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  46.43 
 
 
331 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  43.71 
 
 
330 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  40.56 
 
 
360 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.88 
 
 
331 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.21 
 
 
330 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  42.86 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.11 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  42.22 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  44.91 
 
 
330 aa  281  9e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  42.68 
 
 
321 aa  280  3e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  38.92 
 
 
330 aa  276  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.52 
 
 
331 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  38.32 
 
 
330 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.93 
 
 
319 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  35.14 
 
 
331 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  36.78 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  38.41 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  39.75 
 
 
322 aa  233  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.38 
 
 
329 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  36.89 
 
 
333 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.58 
 
 
328 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.25 
 
 
326 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  27.49 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  31.53 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  30.38 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.75 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 
325 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.22 
 
 
325 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  26.51 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.01 
 
 
545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  26.51 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 
350 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  25.15 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  24.55 
 
 
343 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.58 
 
 
598 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  24.7 
 
 
339 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.6 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.08 
 
 
343 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.62 
 
 
339 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.02 
 
 
343 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.16 
 
 
544 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.63 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  25.58 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.48 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.24 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.69 
 
 
550 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.76 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  24.52 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.24 
 
 
343 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.06 
 
 
347 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 
338 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  25.46 
 
 
346 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.76 
 
 
594 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.81 
 
 
558 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  24.68 
 
 
331 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  28.39 
 
 
333 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 
333 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 
342 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  23.77 
 
 
326 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.28 
 
 
344 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.06 
 
 
731 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.96 
 
 
344 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  23.25 
 
 
323 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  21.96 
 
 
343 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.68 
 
 
553 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.91 
 
 
346 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  23.88 
 
 
343 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.82 
 
 
342 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  23.08 
 
 
343 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.87 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.07 
 
 
559 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  23.3 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  24.62 
 
 
525 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.33 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  23.36 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 
402 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.93 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  27.15 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 
332 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  20.69 
 
 
570 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>