153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1082 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 327 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.43 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  48.94 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  46.61 
 
 		 333 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  47.89 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  48.07 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  48.36 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  45.15 
 
 		 360 aa  308  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.64 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  45.24 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  44.25 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.64 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.24 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  46.29 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.71 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.26 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.18 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  42.26 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.51 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  44.48 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  44.35 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  41.79 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.75 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  42.67 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.54 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  41.67 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.67 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  38.51 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.44 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  44.94 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  42.72 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.62 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  45.77 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  38.46 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.8 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  37.01 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  38.41 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  36.89 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  31.31 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  31.14 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.48 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  29.88 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.28 
 
 		 525 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.23 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.55 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.85 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.85 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.41 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.04 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 598 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.1 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.38 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.51 
 
 		 545 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.39 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.97 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  26.18 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.78 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.15 
 
 		 544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.68 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.83 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  27.04 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  26.05 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  27 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.09 
 
 		 594 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.48 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  23.62 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.69 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  26.37 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  25.71 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.83 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  24.38 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.21 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  22.7 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  25.07 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.94 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  24.6 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  25.24 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.01 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.98 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.95 
 
 		 559 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  22.58 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.15 
 
 		 550 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.64 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  24.69 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  26.01 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.48 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  22.9 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  26.58 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.83 
 
 		 570 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.6 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.84 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>