174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3218 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 331 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.38 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.38 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  48.93 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  39.59 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.5 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.86 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.25 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.74 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.63 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.21 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.31 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  29.24 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.65 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.3 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.52 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  30.49 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.55 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.6 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.25 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  28.36 
 
 		 525 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 		 731 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.16 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.88 
 
 		 580 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.85 
 
 		 731 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.64 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.71 
 
 		 545 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.34 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 		 553 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  26.76 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.77 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.99 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.41 
 
 		 570 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 727 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  24.75 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.92 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  23.35 
 
 		 598 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.07 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  22.91 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.87 
 
 		 559 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.33 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.76 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 		 331 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  24.91 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.16 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  23.49 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  25.09 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.65 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 		 329 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  22.8 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  23.64 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 558 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  23.05 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  21.15 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  21.86 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.7 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.18 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.88 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.75 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.51 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  22.5 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  23.21 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  27.75 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.91 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.73 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.19 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.75 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.31 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  21.56 
 
 		 594 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  21.07 
 
 		 691 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.83 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.41 
 
 		 544 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.75 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.28 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  25.14 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  25.94 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.13 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.68 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.29 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  24.42 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  24.3 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.25 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.71 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  24.35 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.3 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.75 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.09 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  22.89 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.37 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>