163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1800 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 691 aa  1357    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.22 
 
 		 553 aa  146  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.53 
 
 		 550 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  27.83 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.09 
 
 		 570 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  32.45 
 
 		 336 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.83 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.86 
 
 		 339 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  27.74 
 
 		 727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.05 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.56 
 
 		 339 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.1 
 
 		 594 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 329 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.13 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.88 
 
 		 545 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.56 
 
 		 598 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 		 325 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.36 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.45 
 
 		 339 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.95 
 
 		 325 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.86 
 
 		 559 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.24 
 
 		 343 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.67 
 
 		 330 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.74 
 
 		 342 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.03 
 
 		 344 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.87 
 
 		 332 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.61 
 
 		 333 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 325 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 325 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.06 
 
 		 334 aa  116  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.97 
 
 		 337 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 341 aa  114  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.74 
 
 		 347 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.91 
 
 		 343 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  32.47 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.21 
 
 		 344 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  27.03 
 
 		 343 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  32.48 
 
 		 525 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.65 
 
 		 331 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  32.99 
 
 		 344 aa  109  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  35 
 
 		 344 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.06 
 
 		 339 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  32.61 
 
 		 343 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.91 
 
 		 544 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  27.07 
 
 		 334 aa  108  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.17 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  28.4 
 
 		 343 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.79 
 
 		 338 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  28.88 
 
 		 334 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 332 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.75 
 
 		 342 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.92 
 
 		 343 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.24 
 
 		 346 aa  101  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  33.56 
 
 		 323 aa  100  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28.15 
 
 		 337 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.46 
 
 		 320 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  29.29 
 
 		 343 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.67 
 
 		 350 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 331 aa  99  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.17 
 
 		 326 aa  98.6  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.57 
 
 		 344 aa  98.6  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 		 343 aa  98.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.89 
 
 		 347 aa  98.2  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  29.33 
 
 		 336 aa  97.8  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 325 aa  97.8  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.25 
 
 		 322 aa  97.4  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  30.64 
 
 		 343 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.13 
 
 		 371 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.13 
 
 		 344 aa  95.5  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.37 
 
 		 330 aa  95.1  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  28.9 
 
 		 330 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  24.39 
 
 		 326 aa  94.7  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.5 
 
 		 333 aa  94.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  24.81 
 
 		 331 aa  94  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.93 
 
 		 326 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.41 
 
 		 343 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.08 
 
 		 343 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.23 
 
 		 344 aa  91.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  27.11 
 
 		 343 aa  92  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  32.64 
 
 		 323 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  29.3 
 
 		 346 aa  90.9  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.65 
 
 		 343 aa  90.5  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.07 
 
 		 331 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.52 
 
 		 306 aa  90.5  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  24.09 
 
 		 330 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.39 
 
 		 328 aa  90.1  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  29.9 
 
 		 346 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.57 
 
 		 337 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.4 
 
 		 331 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.21 
 
 		 343 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 		 342 aa  88.2  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.91 
 
 		 330 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  22.52 
 
 		 330 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.26 
 
 		 330 aa  87.8  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.34 
 
 		 351 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  27.72 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  26.63 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  22.95 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>