146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0711 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 310 aa  645    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.84 
 
 		 392 aa  298  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  42.95 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.47 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0439  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.14 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.09 
 
 		 545 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.54 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  23.45 
 
 		 727 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  24.23 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  23.48 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.49 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  23.79 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  23.13 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  25.09 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.1 
 
 		 731 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.49 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  23.92 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  24.28 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.55 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.44 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  28.17 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  28.44 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  23.15 
 
 		 731 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.04 
 
 		 559 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.03 
 
 		 550 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  26.64 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  25.82 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.07 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  26 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  23 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.44 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.87 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  21.55 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.26 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.99 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  23.45 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  30.77 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  27.88 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  23.81 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.85 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.49 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.38 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.42 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  22.4 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  22.96 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.65 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.65 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.05 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.24 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.04 
 
 		 558 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  31.45 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.43 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.9 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.79 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.22 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.98 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  25.77 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.22 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.84 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  23.05 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  25.77 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  33.9 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.2 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.7 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.48 
 
 		 544 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.08 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  23.26 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  21.48 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.43 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  22.36 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  29.45 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  24.74 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.18 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  24.72 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.14 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  18.71 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  26.24 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  24.61 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  21.27 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.55 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.27 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.2 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.42 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  23.67 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  21.74 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  23.79 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  22.18 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.06 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  21.35 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.71 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.19 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.41 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.08 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>