172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0573 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  89.92 
 
 
402 aa  747    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
398 aa  823    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  87.66 
 
 
401 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  38.35 
 
 
404 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  27.19 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2176  hypothetical protein  84.38 
 
 
93 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.32 
 
 
325 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  29.37 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.65 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  31.03 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.67 
 
 
559 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.33 
 
 
326 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.52 
 
 
339 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27 
 
 
594 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.91 
 
 
342 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.34 
 
 
598 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.28 
 
 
334 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.64 
 
 
325 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.66 
 
 
570 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.64 
 
 
325 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 
344 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.54 
 
 
306 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  26.27 
 
 
343 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.91 
 
 
325 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  26.62 
 
 
545 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.77 
 
 
550 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
337 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.34 
 
 
342 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  27.7 
 
 
343 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.15 
 
 
337 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.06 
 
 
350 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  27.48 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.32 
 
 
338 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  31.22 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  32.51 
 
 
333 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.34 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.27 
 
 
331 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.49 
 
 
339 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  27.33 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.15 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.7 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.59 
 
 
344 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  28.03 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.97 
 
 
343 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  27.51 
 
 
344 aa  94  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  23.31 
 
 
325 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  26.6 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
330 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  21.99 
 
 
330 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  25.85 
 
 
346 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.35 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.22 
 
 
326 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  24.08 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.36 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  25.33 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.2 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  26.02 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.25 
 
 
333 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  22.51 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.15 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.15 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.82 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.95 
 
 
337 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.82 
 
 
322 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.34 
 
 
344 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.86 
 
 
302 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.12 
 
 
333 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.57 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  22.96 
 
 
330 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.92 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.67 
 
 
544 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.64 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.38 
 
 
731 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.49 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.56 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25.44 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  24.21 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  26.92 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  25.68 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  23.16 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.53 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.61 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  27.42 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  25.89 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.72 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  25 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.52 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.69 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.69 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.22 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  24.36 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.07 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>