174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1275 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  77.21 
 
 
294 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  74.83 
 
 
290 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.22 
 
 
303 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.45 
 
 
302 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  31.56 
 
 
249 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32.6 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.48 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  34.23 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.23 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  29.52 
 
 
351 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.07 
 
 
337 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.03 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  28.43 
 
 
300 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.95 
 
 
342 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.91 
 
 
331 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  25.38 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.16 
 
 
550 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 
336 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.34 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.38 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.22 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.82 
 
 
580 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.3 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.88 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  30.08 
 
 
553 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36.59 
 
 
525 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.76 
 
 
338 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.69 
 
 
1031 aa  85.5  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.15 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.71 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.88 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.51 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.91 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  29.06 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.05 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.95 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.95 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  24.43 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  27.92 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.06 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.29 
 
 
594 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.71 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.93 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.02 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  23.85 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 
330 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.04 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.06 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.36 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.95 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  23 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.06 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  26.07 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  27.6 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.34 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.89 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.14 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.01 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  26.57 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  23.77 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.18 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.88 
 
 
731 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.03 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  25.51 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.19 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.25 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  23.14 
 
 
727 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.22 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  34 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  29.01 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.68 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.62 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.53 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  24.6 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.32 
 
 
731 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.33 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.18 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  34.74 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  30.91 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.61 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  23.83 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.53 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  25.39 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.72 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.32 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.87 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.26 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  22.32 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.94 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.84 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.3 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.51 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>