164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2294 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.48 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.15 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.38 
 
 
294 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  31.14 
 
 
325 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.86 
 
 
351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.68 
 
 
303 aa  115  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.23 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.51 
 
 
290 aa  113  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.56 
 
 
337 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.54 
 
 
342 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.26 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.79 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.49 
 
 
334 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.4 
 
 
306 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  28.52 
 
 
336 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.17 
 
 
337 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.11 
 
 
326 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.67 
 
 
322 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  28.73 
 
 
404 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.57 
 
 
594 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.39 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  31.16 
 
 
325 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.38 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  26.64 
 
 
330 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.05 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  24.7 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  26.92 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.6 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.71 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.84 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.37 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.56 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.01 
 
 
1031 aa  73.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.46 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  26.45 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.24 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  28.63 
 
 
553 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.45 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.24 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  25.61 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.18 
 
 
545 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.42 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.39 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.54 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.02 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.35 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.8 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.16 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  26.64 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.71 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.62 
 
 
550 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.69 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.96 
 
 
731 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  23.53 
 
 
727 aa  65.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  21.11 
 
 
731 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.97 
 
 
544 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.63 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.66 
 
 
333 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.53 
 
 
339 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.87 
 
 
343 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.58 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.56 
 
 
342 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.69 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  30.39 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.11 
 
 
344 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.72 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  24.28 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  24.4 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  31.31 
 
 
338 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  24.43 
 
 
346 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.62 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.1 
 
 
350 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.11 
 
 
343 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  24.15 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  26.39 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
347 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.89 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.17 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  23.18 
 
 
323 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  24.1 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.1 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  24.62 
 
 
342 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.14 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.1 
 
 
570 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.06 
 
 
559 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  23.98 
 
 
339 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  26.55 
 
 
525 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  26.48 
 
 
343 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  21.9 
 
 
691 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  24.39 
 
 
339 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>