106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1231 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  58.9 
 
 		 238 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  52.81 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.37 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  38.06 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.73 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.79 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.79 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  34.32 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.46 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  38.08 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  30.4 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.9 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.62 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.62 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  28.32 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  27.11 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.84 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.06 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  32.89 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.4 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.67 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  32.81 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.72 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  27.44 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.23 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.3 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.8 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.43 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.12 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  35.09 
 
 		 114 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  24.89 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  45.21 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  30.16 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.15 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.6 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  29.12 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  29.1 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  35.29 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.6 
 
 		 1031 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.91 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  32.26 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  33.85 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.83 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.7 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.2 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  27.35 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.98 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  34.43 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.84 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  29.91 
 
 		 691 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.24 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.48 
 
 		 731 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.85 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.1 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  34.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.77 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  30.6 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  29.41 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.6 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.4 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.78 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  32.61 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  30.08 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.23 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.26 
 
 		 570 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.08 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  28.46 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  32.26 
 
 		 207 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.65 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.18 
 
 		 331 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.19 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.6 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  32.11 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.07 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.66 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.18 
 
 		 731 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.08 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.7 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.74 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.62 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.63 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.86 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  33.55 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.2 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  31.54 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.58 
 
 		 559 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.97 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.25 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  31.82 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>