64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2463 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  36.45 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.37 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.69 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  31.7 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.18 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  35.78 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  30.48 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.36 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.91 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  28.02 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.27 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.71 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  31 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.12 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.5 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  33.66 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  27.54 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  35.96 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.64 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  27.06 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.81 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.34 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  38.89 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.85 
 
 		 553 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.8 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  25.7 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.96 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  29.91 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  28.47 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.5 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  28.39 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.05 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.32 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  28.1 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.5 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.44 
 
 		 594 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 		 1031 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.31 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.69 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  18.92 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  34.48 
 
 		 558 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.1 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  22.37 
 
 		 691 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.3 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.73 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 545 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  21.77 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.09 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.45 
 
 		 550 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.18 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  21.37 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.73 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.08 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.42 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>