77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3119 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 298 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  40.86 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  38.54 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.45 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.25 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  38.1 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.3 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.94 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  32.9 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.45 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.05 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.39 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.72 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.74 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  32.96 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.38 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  37 
 
 		 238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  36.4 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.44 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.58 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  28.46 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.08 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.53 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 545 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.29 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.23 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.03 
 
 		 594 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.07 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  39.06 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.66 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  29.89 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.92 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.38 
 
 		 550 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  24.07 
 
 		 691 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.75 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.52 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  37.97 
 
 		 558 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.68 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.63 
 
 		 570 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  40 
 
 		 1031 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.2 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  24.5 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.02 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.71 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.59 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.91 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.22 
 
 		 598 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  24.64 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  40 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.03 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.93 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.94 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  36.07 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  22.69 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.6 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.64 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.86 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.57 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.15 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  31.68 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.5 
 
 		 559 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.33 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.55 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  40 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  30 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  21.75 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>