97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2009 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 311 aa  646    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  33.9 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  29.59 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.89 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  30.48 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.48 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.92 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.54 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.12 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  20.79 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  22.18 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  24.6 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.71 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.86 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  23.94 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.16 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  26.45 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.97 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.97 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.43 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  22.86 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.2 
 
 		 1031 aa  59.3  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  24.64 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  22.05 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.71 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.62 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.98 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.99 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  32.17 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.42 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  38.38 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.41 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.3 
 
 		 570 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28.47 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  32.48 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.17 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.54 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.97 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.6 
 
 		 326 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.91 
 
 		 550 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.22 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.83 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.01 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  28 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.85 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  27.97 
 
 		 114 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.14 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.23 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.99 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  22.82 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.62 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  40 
 
 		 559 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.85 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.97 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  27.96 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.96 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.33 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.85 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  35.63 
 
 		 594 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.18 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.03 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  21.27 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.21 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.93 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  23.96 
 
 		 330 aa  45.8  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  26.9 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  35.23 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.61 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.67 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.7 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.31 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.9 
 
 		 731 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.56 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.95 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.47 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  32.18 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  22.79 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.87 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.24 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  30.53 
 
 		 173 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  38.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.07 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  23.67 
 
 		 731 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  23.74 
 
 		 207 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  23.48 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>