164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0161 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  685    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32.83 
 
 
336 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.96 
 
 
337 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.96 
 
 
306 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 
337 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.59 
 
 
337 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.88 
 
 
338 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.8 
 
 
343 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.41 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  30.25 
 
 
343 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 
343 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 
336 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.2 
 
 
1031 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.27 
 
 
553 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  29.39 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.06 
 
 
344 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  27.34 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  26.47 
 
 
339 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.33 
 
 
344 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.42 
 
 
333 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  25.33 
 
 
346 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  29.92 
 
 
343 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  29.24 
 
 
342 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.56 
 
 
342 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.52 
 
 
343 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.78 
 
 
331 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.76 
 
 
339 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30.39 
 
 
594 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  28.41 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  27.48 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  26.98 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.68 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.17 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.2 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.56 
 
 
343 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  29.96 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  26.05 
 
 
545 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.56 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  26.45 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  26.24 
 
 
598 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  28 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  28.36 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.28 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.78 
 
 
350 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.92 
 
 
544 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  28.16 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.52 
 
 
343 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.84 
 
 
343 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.04 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  26.14 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  28.82 
 
 
344 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  27.84 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.67 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.82 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  27.46 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.82 
 
 
325 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28.9 
 
 
325 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  30.04 
 
 
325 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.35 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.69 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.71 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.07 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.47 
 
 
559 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.96 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  29.05 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.94 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  23.4 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.83 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.6 
 
 
570 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.94 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  26.64 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  26.92 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.68 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  29.6 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.91 
 
 
731 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.4 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.57 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.97 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 
731 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.53 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.34 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  27.66 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.13 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.99 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  26.2 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  24.34 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.21 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.88 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  26.46 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.78 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.26 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.33 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  25.1 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.38 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  23.99 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>