170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2282 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 300 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  33.45 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.62 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.58 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.85 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.33 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.99 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  31.62 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.56 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.05 
 
 		 553 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.43 
 
 		 1031 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  28.47 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  31.33 
 
 		 325 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  26.79 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.06 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.19 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.43 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  30.98 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.31 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  26.35 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.88 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.33 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.64 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  28.02 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.75 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.34 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  32.16 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.08 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  26.21 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  26.59 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.66 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.97 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.8 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.8 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.81 
 
 		 545 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.03 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.26 
 
 		 342 aa  85.5  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.74 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  29.18 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.1 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.79 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  26.44 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.25 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.38 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.17 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.8 
 
 		 550 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.35 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  26.61 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.38 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  28.9 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  24.51 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.07 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.24 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  25.85 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  39.45 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.58 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.98 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.68 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.23 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.9 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.45 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  28.46 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.93 
 
 		 580 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.81 
 
 		 731 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.97 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.79 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  29.15 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.97 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  25.88 
 
 		 691 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  26.85 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.21 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.37 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  23.13 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  35.4 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.88 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.47 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  36.02 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  24.8 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.64 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.33 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>