171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1123 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
294 aa  584  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  77.21 
 
 
294 aa  432  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.21 
 
 
290 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.12 
 
 
303 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.57 
 
 
302 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  31.97 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.31 
 
 
336 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.91 
 
 
306 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.75 
 
 
338 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.61 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.82 
 
 
337 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  28.01 
 
 
351 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  26.69 
 
 
325 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  30.28 
 
 
337 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  29.34 
 
 
300 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.17 
 
 
322 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 
342 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  32.87 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.92 
 
 
550 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.06 
 
 
545 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.45 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.31 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.95 
 
 
325 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.95 
 
 
325 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 
525 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.48 
 
 
331 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.37 
 
 
334 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  32.55 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  29.95 
 
 
325 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.76 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  27.92 
 
 
553 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  26.01 
 
 
404 aa  85.9  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.61 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.31 
 
 
344 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.08 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.07 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.24 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.92 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.1 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  32.93 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.66 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.56 
 
 
1031 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.81 
 
 
580 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.55 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  25.81 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.61 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.46 
 
 
598 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.52 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.68 
 
 
731 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.73 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.52 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  25.51 
 
 
727 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.99 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  24 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.02 
 
 
594 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.66 
 
 
570 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.53 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  25.42 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  25.23 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.98 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  30.22 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  27.39 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.93 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  26.69 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  31.2 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  31.45 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  28.8 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.41 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.33 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.53 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.36 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  41.49 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  26.62 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  27.09 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30.6 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.84 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.69 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.59 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  23.79 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  29.31 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.76 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.49 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  22.63 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  28.74 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  22.57 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  40.43 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.99 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  24.25 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.07 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  22.92 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  22.92 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>