163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0578 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
303 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.12 
 
 
294 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.88 
 
 
294 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  38.46 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.8 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  34.24 
 
 
336 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.25 
 
 
306 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.83 
 
 
337 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.22 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  33 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.76 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  34.5 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  30.68 
 
 
249 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.04 
 
 
326 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  28.08 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 
331 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.12 
 
 
322 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.16 
 
 
332 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 
343 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  29.96 
 
 
336 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.35 
 
 
525 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.54 
 
 
339 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.52 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
336 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.48 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.11 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.46 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.56 
 
 
553 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.33 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.6 
 
 
341 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0263  hypothetical protein  49.52 
 
 
152 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 
727 aa  92.4  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.93 
 
 
550 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.65 
 
 
344 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  27.12 
 
 
404 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 
594 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.63 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.24 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.63 
 
 
1031 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  29.8 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  30 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  39.31 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.51 
 
 
731 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.32 
 
 
731 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.78 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.07 
 
 
350 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  32.16 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  29.39 
 
 
343 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.96 
 
 
545 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.93 
 
 
342 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  29.73 
 
 
330 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.37 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.51 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.39 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.91 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.33 
 
 
580 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  27.92 
 
 
598 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.72 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  39.31 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  39.31 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  29.84 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  31.56 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  30.63 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  28.95 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.1 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.62 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.91 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.72 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  31.4 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.74 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.98 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.38 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.26 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.82 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.14 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.14 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  34.27 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  30.96 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.57 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  29.77 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  25.41 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  29.37 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  30.17 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.41 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.25 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.02 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  31.22 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.01 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  24.01 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.69 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.59 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  33.2 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.97 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.02 
 
 
544 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.89 
 
 
570 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.31 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  25.35 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>