104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0344 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.99 
 
 		 299 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.32 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  38.1 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  38.78 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.96 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.6 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  31.16 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  45.5 
 
 		 238 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  31.33 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.11 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.05 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.25 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  36.88 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.98 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.53 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  26.33 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.75 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  26.5 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  30.86 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.44 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  32.09 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  35.34 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  26.36 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  25.71 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.52 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.46 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.24 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.93 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  27.05 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  21.92 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.17 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  47.27 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.74 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.71 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.11 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  28.99 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.59 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.69 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  36.22 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.48 
 
 		 1031 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.98 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.22 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.17 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.22 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  25.93 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.47 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  25.93 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.17 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  24.36 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.68 
 
 		 553 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.12 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  20.65 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.16 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.09 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  29.17 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  26.11 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  24.8 
 
 		 594 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.87 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  35 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 691 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  23.48 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  29.63 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.17 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.44 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.57 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.66 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.61 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.62 
 
 		 570 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  32.41 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.29 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.61 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.23 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.07 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.37 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  37.31 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  19.23 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.88 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.29 
 
 		 731 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.67 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  23.46 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  23.81 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.2 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.42 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.15 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  29.84 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.87 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 731 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.56 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.57 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  28.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  24.09 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>