21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0450 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  332  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  32.67 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  32.02 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.95 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.81 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.81 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.15 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  28.46 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.58 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.6 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.67 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  25.15 
 
 		 297 aa  53.9  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  25.93 
 
 		 302 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.89 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  21.79 
 
 		 308 aa  45.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  30.53 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.22 
 
 		 298 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.49 
 
 		 294 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>