80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0710 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  38.54 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  36.33 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  36.4 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.54 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  31.1 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.57 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.81 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.9 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.2 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.81 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.11 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.78 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  31.33 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.35 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.57 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  33.47 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  30.49 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  34 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  22.18 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.14 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  30.36 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.94 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  32.61 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  30.2 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.85 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.06 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  32.63 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.75 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.34 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 731 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  29.12 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.11 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.36 
 
 		 402 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 		 398 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.63 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.74 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.73 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  23.57 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  23.83 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.83 
 
 		 594 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.14 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  26.76 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.27 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  37.93 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.43 
 
 		 550 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  24.79 
 
 		 691 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.09 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.94 
 
 		 553 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  33.94 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.21 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.86 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.79 
 
 		 570 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  29.47 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.15 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  24.69 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.72 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.75 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  25.64 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.18 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  36.51 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.61 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  35.63 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.46 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.41 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.03 
 
 		 580 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.43 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.51 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  27.83 
 
 		 139 aa  43.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.36 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.08 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.76 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.92 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>