42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0451 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.3 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  32.35 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  40.37 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.68 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.09 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.56 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  36.28 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  60 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.37 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.39 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.5 
 
 		 298 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  32.74 
 
 		 289 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.11 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  35.34 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.86 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  30.97 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  27.97 
 
 		 311 aa  50.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.44 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  39.34 
 
 		 325 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.67 
 
 		 337 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  36.23 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.47 
 
 		 294 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  36.23 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.39 
 
 		 1031 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.77 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  39.34 
 
 		 207 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.9 
 
 		 334 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.37 
 
 		 326 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.84 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.79 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 		 691 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  39.34 
 
 		 731 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  38.33 
 
 		 325 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.38 
 
 		 731 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 351 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>