119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1321 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 327 aa  664    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  28.12 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.71 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  27.16 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.66 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.52 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  24.84 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.35 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.89 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.11 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.8 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  22.65 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  30.87 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.32 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.43 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  32.5 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  21.93 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 		 1031 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.12 
 
 		 550 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  30.05 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.25 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  28.24 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.77 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  24.89 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  34.21 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.85 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  25.35 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  39.02 
 
 		 598 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  38.67 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 		 325 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.49 
 
 		 559 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.18 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.59 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  27.35 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.78 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  30.71 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.6 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.14 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.99 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.31 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  22.37 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  30.93 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.34 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  27.14 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  27.55 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.74 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.92 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  23.11 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.2 
 
 		 580 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.61 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.59 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.09 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  26.91 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  26.86 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  32.35 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  35 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.14 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  32.05 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  21.88 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  34.04 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  32.38 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  28.3 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.19 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  39.34 
 
 		 594 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.02 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.08 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  34.04 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.79 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.82 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.66 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  42.31 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.36 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.74 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  25.45 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.51 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  42.31 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.58 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.98 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.54 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.34 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.15 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.93 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.23 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>