149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1405 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  52.48 
 
 		 655 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  100 
 
 		 671 aa  1353    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  50.15 
 
 		 631 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  53.43 
 
 		 642 aa  691    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  52.94 
 
 		 658 aa  701    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  40.99 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  39.37 
 
 		 625 aa  445  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  39.03 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  37.41 
 
 		 640 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  38.47 
 
 		 631 aa  439  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  35.98 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  34.98 
 
 		 633 aa  398  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  45.77 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  35.43 
 
 		 630 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  35.28 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  34.23 
 
 		 597 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  34.55 
 
 		 634 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  35.17 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  32.74 
 
 		 651 aa  348  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  31.03 
 
 		 605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  36.93 
 
 		 530 aa  276  9e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  34.52 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  31.92 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  33.19 
 
 		 521 aa  243  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  33.04 
 
 		 517 aa  242  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  32.45 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  32.53 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  31.64 
 
 		 520 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 693 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 693 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  27.09 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 785 aa  51.2  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  28.65 
 
 		 327 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  25.85 
 
 		 388 aa  51.2  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  27.84 
 
 		 738 aa  50.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 580 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  29 
 
 		 365 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 601 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  29.38 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  31.43 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  26.29 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  26.79 
 
 		 604 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  31.37 
 
 		 356 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  26.27 
 
 		 356 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  33.33 
 
 		 383 aa  48.5  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  24.22 
 
 		 626 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  28.02 
 
 		 366 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  30.47 
 
 		 369 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  29.53 
 
 		 592 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  30.22 
 
 		 494 aa  48.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 569 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  25.71 
 
 		 794 aa  47.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  29.69 
 
 		 369 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  30.43 
 
 		 497 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  26.46 
 
 		 557 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  26.9 
 
 		 374 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  26.63 
 
 		 365 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  24.86 
 
 		 438 aa  47  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  24.67 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  26.47 
 
 		 365 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  27.35 
 
 		 579 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  22.96 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  31.34 
 
 		 583 aa  47.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  29.69 
 
 		 369 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  26.46 
 
 		 557 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  30.43 
 
 		 497 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  26.49 
 
 		 871 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  26.15 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  28.12 
 
 		 388 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  28.12 
 
 		 385 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  24 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  30 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  27.27 
 
 		 363 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  26.7 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 806 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  26.81 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  25.54 
 
 		 702 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.15 
 
 		 558 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  26.19 
 
 		 473 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  29.69 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  25.21 
 
 		 569 aa  45.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  24.46 
 
 		 574 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  27.45 
 
 		 613 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  23.01 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.11 
 
 		 325 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  24.78 
 
 		 623 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  30.43 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  30.43 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  26.46 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>