141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1925 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  64.97 
 
 
510 aa  686    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  100 
 
 
506 aa  1024    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  46.73 
 
 
530 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  46.5 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  43.8 
 
 
519 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  45.33 
 
 
520 aa  424  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  43.44 
 
 
521 aa  420  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  44.47 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  40.62 
 
 
597 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  38.64 
 
 
602 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  42.44 
 
 
605 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  40 
 
 
634 aa  359  8e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  38.83 
 
 
651 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  38.31 
 
 
633 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  38.48 
 
 
625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  39.41 
 
 
629 aa  355  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  37.95 
 
 
631 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  38.23 
 
 
618 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  39.11 
 
 
630 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  38.92 
 
 
630 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  39.11 
 
 
630 aa  346  6e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  42.51 
 
 
640 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  36.11 
 
 
633 aa  332  9e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  36.49 
 
 
631 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  36.88 
 
 
655 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  35.91 
 
 
658 aa  296  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  35.07 
 
 
642 aa  279  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  34.52 
 
 
671 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  27.88 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  32.45 
 
 
574 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  26.64 
 
 
445 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.73 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  22.65 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  31.54 
 
 
356 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.82 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  30.82 
 
 
569 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  29.24 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
348 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  22.65 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
318 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  29.26 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  25.82 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
423 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  27.61 
 
 
324 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  27.61 
 
 
324 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  25.15 
 
 
317 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  27.12 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  30.46 
 
 
574 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  26.57 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  30.26 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  30.19 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.93 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  30.91 
 
 
416 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  30.47 
 
 
671 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  24.89 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.97 
 
 
489 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
492 aa  47.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
311 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.96 
 
 
472 aa  47.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  24.71 
 
 
456 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
449 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
677 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
591 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
492 aa  47  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.57 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
580 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  26.74 
 
 
575 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
637 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
684 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  26.98 
 
 
791 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  27.23 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  25.82 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.04 
 
 
325 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  25.82 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.67 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  25.82 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  23.76 
 
 
823 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  29.53 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  29.87 
 
 
688 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  27.32 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  27.78 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  28.93 
 
 
322 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  30.5 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.95 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  30.5 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.62 
 
 
468 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  28.93 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3387  type II secretion system protein E  34.33 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.729797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.3 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  26.56 
 
 
519 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.93 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.56 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  32.14 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  27.32 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  29.12 
 
 
566 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  28.06 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>