More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2007 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2007  ATPase  100 
 
 		 631 aa  1268    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  51.64 
 
 		 671 aa  677    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  63.31 
 
 		 642 aa  820    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  62.29 
 
 		 655 aa  818    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  65.4 
 
 		 658 aa  859    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  46.5 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  45.18 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  44.11 
 
 		 625 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  42.45 
 
 		 618 aa  522  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  44.01 
 
 		 631 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  42.34 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  43.19 
 
 		 629 aa  506  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  41.19 
 
 		 633 aa  488  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  39.84 
 
 		 634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  39.65 
 
 		 630 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  39.17 
 
 		 630 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  39.01 
 
 		 630 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  37.46 
 
 		 651 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  36.51 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  37.97 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  36.84 
 
 		 530 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  36.49 
 
 		 506 aa  304  4.0000000000000003e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  34.75 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  36.15 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  36.59 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  36.34 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  34.76 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  36.17 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  25.35 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.06 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  28.94 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  31.4 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.5 
 
 		 480 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  30.3 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  30.58 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 608 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  28.09 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.58 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.65 
 
 		 485 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  29.56 
 
 		 452 aa  55.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  27.12 
 
 		 438 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 469 aa  54.7  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  29.74 
 
 		 325 aa  54.7  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  28 
 
 		 343 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 462 aa  54.7  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 579 aa  54.7  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  30 
 
 		 560 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 455 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.58 
 
 		 488 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 464 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 408 aa  54.3  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  28.73 
 
 		 346 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.23 
 
 		 455 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  32 
 
 		 508 aa  53.9  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 459 aa  53.9  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.81 
 
 		 449 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 460 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.31 
 
 		 473 aa  53.9  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.29 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  29.65 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  27.66 
 
 		 326 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  29.65 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  31.64 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  32.31 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.4 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.4 
 
 		 311 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 684 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  30 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.01 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  28.72 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.82 
 
 		 325 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  24.64 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  28 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  29.21 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  29.71 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  30 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.49 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 489 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  28.17 
 
 		 327 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>