More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1385 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1385  ATPase  100 
 
 		 519 aa  1024    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  84.39 
 
 		 517 aa  895    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  82.5 
 
 		 518 aa  875    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  83.82 
 
 		 520 aa  893    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  54.42 
 
 		 521 aa  561  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  50.76 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  45.45 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  43.8 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  39.5 
 
 		 605 aa  394  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  40.12 
 
 		 597 aa  352  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  40.23 
 
 		 634 aa  347  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  38.79 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  38.45 
 
 		 651 aa  343  5e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 625 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  36.99 
 
 		 633 aa  339  8e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  38.88 
 
 		 630 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  40.3 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  37.55 
 
 		 631 aa  332  8e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  38.65 
 
 		 630 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  37.77 
 
 		 630 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  39.19 
 
 		 618 aa  330  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  36.87 
 
 		 629 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  36.81 
 
 		 633 aa  309  8e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  34.79 
 
 		 631 aa  270  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  32.29 
 
 		 655 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  33.63 
 
 		 658 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  34.89 
 
 		 642 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  32.45 
 
 		 671 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  24.94 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  30.73 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  33.57 
 
 		 574 aa  57  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 569 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  25.99 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  26.09 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  25.22 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.75 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  31.01 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  25.69 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  25 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  24.21 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 423 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  27.19 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  29.17 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  26.46 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 316 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  28.49 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.51 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  28.49 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  32.86 
 
 		 574 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  28.49 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  28.49 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 348 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  28.49 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  28.49 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  33.06 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  28.49 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 468 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  32.14 
 
 		 574 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.04 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 573 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 573 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  30.86 
 
 		 469 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  23.51 
 
 		 372 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  27.19 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 513 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  23.33 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.72 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  26.42 
 
 		 589 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 584 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0559  type II secretion system protein E  29.26 
 
 		 1126 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  29.49 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  24.56 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  30.25 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  27 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  25.85 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  26.45 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  24.68 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  26.92 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  31.55 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  27.01 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  30.53 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  22.76 
 
 		 366 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  24.56 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  24.27 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  26.58 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  26.23 
 
 		 521 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 671 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 693 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  25.29 
 
 		 355 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>