218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0722 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0503  ATPase  68.2 
 
 		 633 aa  848    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  71.36 
 
 		 625 aa  880    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  65.63 
 
 		 629 aa  803    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  70.62 
 
 		 631 aa  864    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  100 
 
 		 633 aa  1251    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  48.97 
 
 		 602 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  49.13 
 
 		 618 aa  572  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  45.96 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  42.7 
 
 		 651 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  43.01 
 
 		 630 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  44.62 
 
 		 634 aa  497  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  42.61 
 
 		 630 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  41.04 
 
 		 631 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  41.82 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  39.76 
 
 		 658 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  38.59 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  39.97 
 
 		 642 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  48.19 
 
 		 597 aa  463  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  38.35 
 
 		 605 aa  430  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  35.58 
 
 		 671 aa  405  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  41.56 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  38.84 
 
 		 510 aa  346  8e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  36.11 
 
 		 506 aa  332  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  39.4 
 
 		 521 aa  330  7e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  37.67 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  36.67 
 
 		 518 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  36.81 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  35.73 
 
 		 520 aa  306  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  27.96 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  26.62 
 
 		 478 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 469 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.79 
 
 		 445 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 482 aa  54.7  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  25.19 
 
 		 785 aa  54.3  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 423 aa  54.3  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.81 
 
 		 325 aa  53.9  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  27.66 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  27.66 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  28.41 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.81 
 
 		 333 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.41 
 
 		 322 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.12 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.17 
 
 		 453 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 464 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  30.86 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  23.16 
 
 		 462 aa  51.2  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  25.37 
 
 		 521 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.27 
 
 		 322 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  24.24 
 
 		 423 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  25.37 
 
 		 523 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  25.37 
 
 		 523 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 408 aa  51.2  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  25.37 
 
 		 515 aa  50.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  25.43 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  25.37 
 
 		 520 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  25.37 
 
 		 520 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  25.37 
 
 		 520 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  25.43 
 
 		 466 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 575 aa  50.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  26.52 
 
 		 538 aa  50.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  27.5 
 
 		 323 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 450 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  26.88 
 
 		 358 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 480 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 482 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.25 
 
 		 343 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  27.72 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  26.83 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  29.65 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  27.04 
 
 		 327 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  26.15 
 
 		 332 aa  49.7  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  25.29 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  27.27 
 
 		 560 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  25.68 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 449 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  24.68 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  24.68 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 500 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  27.69 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  28.57 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  27.69 
 
 		 433 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  28.43 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>