234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1392 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  79.94 
 
 		 634 aa  1026    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  67.19 
 
 		 651 aa  848    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  96.03 
 
 		 630 aa  1226    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  100 
 
 		 630 aa  1267    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  95.56 
 
 		 630 aa  1219    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  45.63 
 
 		 602 aa  545  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  45.57 
 
 		 618 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  44.81 
 
 		 640 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  43.77 
 
 		 605 aa  514  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  45.17 
 
 		 629 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  43.79 
 
 		 631 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  44.07 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  43.32 
 
 		 625 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  42.52 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  43.73 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  38.83 
 
 		 631 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  37.08 
 
 		 658 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  36 
 
 		 655 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  36.93 
 
 		 642 aa  405  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  35.28 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  43.25 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  41.2 
 
 		 510 aa  353  7e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  40.16 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  40.16 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  39.11 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  38.83 
 
 		 520 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  36.12 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  37.77 
 
 		 519 aa  331  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.18 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 408 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  29.21 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 416 aa  52.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  27.47 
 
 		 492 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  33.59 
 
 		 560 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 481 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.4 
 
 		 328 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.8 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 411 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 608 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 428 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 482 aa  51.2  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.61 
 
 		 428 aa  51.2  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.61 
 
 		 428 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 334 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.48 
 
 		 412 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  27.23 
 
 		 423 aa  50.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.27 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.22 
 
 		 432 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.49 
 
 		 558 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  25.77 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  27.5 
 
 		 334 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  26.01 
 
 		 463 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.5 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.82 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  30.67 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  32 
 
 		 390 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  26.74 
 
 		 438 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.03 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 456 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.14 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 385 aa  48.5  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  26.23 
 
 		 411 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  28.39 
 
 		 497 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  29.63 
 
 		 442 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  28.39 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  28.39 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  28.77 
 
 		 370 aa  47.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  28.39 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  28.39 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 408 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  32.76 
 
 		 359 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  24.09 
 
 		 444 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 311 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  28.75 
 
 		 305 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 348 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 452 aa  47.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  26.87 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>