More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1054 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  100 
 
 		 605 aa  1222    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  46.15 
 
 		 634 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  43.77 
 
 		 630 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  43.08 
 
 		 651 aa  512  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  43.44 
 
 		 630 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  43.44 
 
 		 630 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  44.07 
 
 		 602 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  42.23 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  41.23 
 
 		 633 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  42.46 
 
 		 618 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  40.78 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  44.72 
 
 		 631 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  44.4 
 
 		 597 aa  435  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  37.89 
 
 		 633 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  39.67 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  36.51 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  40.92 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  39.73 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  40.81 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  39.5 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  33.84 
 
 		 658 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  42.31 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  34.25 
 
 		 655 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  34.33 
 
 		 642 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  40.8 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  38.2 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  42.44 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  31.03 
 
 		 671 aa  330  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  28.5 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  26.73 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  28.36 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  27.33 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  27.33 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  28 
 
 		 514 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  26.63 
 
 		 518 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  30.77 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 485 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  27.12 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  27.61 
 
 		 423 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  29.24 
 
 		 327 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  27.89 
 
 		 841 aa  53.9  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  53.9  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  53.9  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  27.11 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  28.42 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  28.42 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  32 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  29.94 
 
 		 490 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  29.8 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  32 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 358 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28 
 
 		 491 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  32 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28 
 
 		 491 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  28.16 
 
 		 871 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32 
 
 		 482 aa  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 408 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  27.39 
 
 		 502 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 445 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  28 
 
 		 467 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  28 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  29.28 
 
 		 521 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  27.39 
 
 		 502 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.46 
 
 		 572 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  29.27 
 
 		 311 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.76 
 
 		 558 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  28 
 
 		 490 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 489 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 482 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  27.71 
 
 		 462 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 454 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  26.18 
 
 		 324 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  27.62 
 
 		 574 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  27.74 
 
 		 501 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  26.18 
 
 		 324 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  30 
 
 		 454 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  30 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  30 
 
 		 454 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.05 
 
 		 468 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 563 aa  51.2  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>