259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0672 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  80.84 
 
 		 634 aa  1020    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  67.97 
 
 		 651 aa  848    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  100 
 
 		 630 aa  1264    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  95.56 
 
 		 630 aa  1212    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  96.03 
 
 		 630 aa  1226    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  45.63 
 
 		 602 aa  542  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  45.56 
 
 		 618 aa  526  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  45.07 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  43.44 
 
 		 605 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  45.17 
 
 		 629 aa  510  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  43.63 
 
 		 631 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  44.07 
 
 		 633 aa  505  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  42.44 
 
 		 625 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  42.05 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  43.23 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  38.19 
 
 		 631 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  36.59 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  36.31 
 
 		 655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  37.25 
 
 		 642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  35.17 
 
 		 671 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  42.41 
 
 		 530 aa  360  5e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  41.29 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  39.57 
 
 		 518 aa  350  5e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  40.35 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  39.11 
 
 		 506 aa  346  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  39.42 
 
 		 520 aa  342  8e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  36.43 
 
 		 521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  38.65 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 458 aa  53.9  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 416 aa  53.9  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  33.59 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 478 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  29.21 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 469 aa  53.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.8 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32 
 
 		 428 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32 
 
 		 428 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32 
 
 		 428 aa  52  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.31 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  26.46 
 
 		 328 aa  51.2  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  28.75 
 
 		 305 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  25.62 
 
 		 469 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  26.02 
 
 		 411 aa  51.2  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 454 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  26.92 
 
 		 492 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 492 aa  50.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  27.61 
 
 		 423 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  26.01 
 
 		 463 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.17 
 
 		 432 aa  50.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  30.3 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  28.12 
 
 		 327 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  25.77 
 
 		 585 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.48 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  30.67 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 390 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 456 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.03 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  26.74 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.33 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  25.63 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  28.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  29.63 
 
 		 442 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  28.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  29.45 
 
 		 370 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  23.7 
 
 		 794 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  23.53 
 
 		 772 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  28.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  28.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  28.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 483 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  24.09 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.73 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  27.5 
 
 		 334 aa  48.5  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 348 aa  48.5  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.5 
 
 		 327 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>