154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1639 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 
510 aa  1026    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  64.68 
 
 
506 aa  701    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  46.02 
 
 
517 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  49.79 
 
 
530 aa  450  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  44.87 
 
 
519 aa  443  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  45.87 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  46.3 
 
 
520 aa  435  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  45.14 
 
 
518 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  38.57 
 
 
602 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  45.52 
 
 
597 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  41.77 
 
 
634 aa  375  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  40.8 
 
 
605 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  39.5 
 
 
625 aa  363  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  39.73 
 
 
631 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  39.29 
 
 
651 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  41.2 
 
 
630 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  41.2 
 
 
630 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  41.29 
 
 
630 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  36.33 
 
 
633 aa  348  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  40.94 
 
 
640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  38.07 
 
 
629 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  38.93 
 
 
633 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  39.42 
 
 
618 aa  336  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  34.54 
 
 
658 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  33.94 
 
 
655 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  34.75 
 
 
631 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  33.56 
 
 
642 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  31.92 
 
 
671 aa  262  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.16 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.16 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  31.34 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  26.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  28.96 
 
 
521 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  27.51 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.1 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.1 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.1 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  28.36 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
609 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.28 
 
 
445 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  23.44 
 
 
366 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  29.83 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  26.85 
 
 
409 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
791 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  27.42 
 
 
455 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.72 
 
 
463 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  29.41 
 
 
356 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
467 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.28 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  28.24 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  30.72 
 
 
671 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  28.07 
 
 
428 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.63 
 
 
469 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  30.29 
 
 
572 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  31.65 
 
 
566 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  30.23 
 
 
634 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  27.51 
 
 
491 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  29.14 
 
 
569 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.79 
 
 
441 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  32.2 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
797 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
492 aa  47  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
472 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  25.97 
 
 
504 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.83 
 
 
468 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
455 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  31.91 
 
 
574 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
455 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
489 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
472 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.64 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  26.58 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  26.38 
 
 
324 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  26.38 
 
 
324 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  29.86 
 
 
749 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.67 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  25.12 
 
 
577 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  27.35 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  28.12 
 
 
575 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  32.26 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  27.37 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32 
 
 
563 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  29.77 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.88 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  28.26 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  26.2 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  26.98 
 
 
491 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  27.21 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  28.46 
 
 
455 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  33.08 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.13 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  26.77 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  29.14 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  31.5 
 
 
583 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>