173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0536 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  100 
 
 
530 aa  1063    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  51.71 
 
 
521 aa  497  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  50.76 
 
 
519 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  50.86 
 
 
520 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  51.15 
 
 
517 aa  481  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  50.86 
 
 
518 aa  465  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  46.73 
 
 
506 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  49.79 
 
 
510 aa  449  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  43.07 
 
 
602 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  42.78 
 
 
625 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  42.42 
 
 
631 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  41.98 
 
 
597 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  41.39 
 
 
634 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  42.31 
 
 
605 aa  381  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  41.56 
 
 
633 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  40.93 
 
 
640 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  44.47 
 
 
618 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  38.74 
 
 
633 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  43.25 
 
 
630 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  42.14 
 
 
651 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  42.77 
 
 
630 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  43.76 
 
 
629 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  42.41 
 
 
630 aa  360  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  39.91 
 
 
631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  38.75 
 
 
655 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  37.61 
 
 
642 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  37.28 
 
 
658 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  36.93 
 
 
671 aa  276  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  31.88 
 
 
574 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
342 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  29.14 
 
 
356 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
348 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.12 
 
 
444 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  29.12 
 
 
444 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  31.39 
 
 
574 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.93 
 
 
423 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  27.71 
 
 
428 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  25.93 
 
 
330 aa  50.4  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3387  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
403 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.729797  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  23.95 
 
 
331 aa  49.7  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  28.86 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.14 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  27.78 
 
 
428 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  27.78 
 
 
428 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  27.98 
 
 
408 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0005  conjugative transfer regulon protein  28.57 
 
 
317 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  27.78 
 
 
428 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  27.22 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.44 
 
 
412 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  22.81 
 
 
332 aa  48.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  23.35 
 
 
355 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  28.03 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  28.93 
 
 
441 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  24.6 
 
 
362 aa  47.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  26.81 
 
 
442 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  28.08 
 
 
510 aa  47  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
567 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
468 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  23.93 
 
 
332 aa  47  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.5 
 
 
322 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  26.52 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  32.26 
 
 
311 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  25.2 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
408 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
566 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  25.9 
 
 
584 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  22.58 
 
 
339 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  24.24 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  26.88 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  26.15 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  27.34 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  27.73 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  27.85 
 
 
370 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  28.33 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0247  type IV-A pilus assembly protein PilB  25.63 
 
 
516 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  25.87 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
637 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.26 
 
 
492 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.97 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  25.87 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  27.86 
 
 
770 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  25.12 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  26.98 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.26 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  24.86 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  24.86 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  26.47 
 
 
693 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  23.63 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  26.47 
 
 
693 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  24.86 
 
 
521 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  26.92 
 
 
455 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  29.93 
 
 
472 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
585 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
589 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  24.86 
 
 
520 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  23.15 
 
 
455 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>