233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1292 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  82.44 
 
 
630 aa  1038    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  65.89 
 
 
651 aa  827    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  100 
 
 
634 aa  1256    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  80.84 
 
 
630 aa  1020    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  79.94 
 
 
630 aa  1026    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  48.87 
 
 
602 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  45.22 
 
 
618 aa  529  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  46.15 
 
 
605 aa  529  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  44.25 
 
 
640 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  45.28 
 
 
631 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  45.34 
 
 
629 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  44.99 
 
 
633 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  44.06 
 
 
633 aa  491  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  44.05 
 
 
625 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  44.65 
 
 
597 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  39.24 
 
 
631 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  37.83 
 
 
642 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  37.91 
 
 
658 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  37.06 
 
 
655 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  41.39 
 
 
530 aa  384  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  41.77 
 
 
510 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  34.55 
 
 
671 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  40.85 
 
 
518 aa  364  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  41.2 
 
 
517 aa  363  4e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  39.12 
 
 
521 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  41.51 
 
 
520 aa  362  1e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  40 
 
 
506 aa  359  9.999999999999999e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  40.23 
 
 
519 aa  347  5e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.83 
 
 
404 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.79 
 
 
462 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
467 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
466 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  29.07 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.67 
 
 
455 aa  54.3  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  27.43 
 
 
408 aa  53.9  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  27.91 
 
 
438 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
469 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  30.9 
 
 
383 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  27.66 
 
 
521 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  24.19 
 
 
332 aa  52  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.93 
 
 
481 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0005  conjugative transfer regulon protein  29.85 
 
 
317 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  26.87 
 
 
423 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
492 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.2 
 
 
472 aa  51.6  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.91 
 
 
451 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  32.81 
 
 
560 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  25.1 
 
 
434 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  26.01 
 
 
463 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.14 
 
 
467 aa  50.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
455 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  24.6 
 
 
370 aa  50.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  25.1 
 
 
445 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  26.03 
 
 
423 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  28.85 
 
 
482 aa  50.4  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  25.58 
 
 
451 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  26.32 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
428 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.07 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  28.14 
 
 
498 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  28.49 
 
 
468 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
608 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.6 
 
 
428 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  26.32 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  26.32 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  25.58 
 
 
451 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.6 
 
 
428 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  28.49 
 
 
447 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  27.04 
 
 
514 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  31.13 
 
 
455 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30 
 
 
474 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  34.88 
 
 
369 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  26.49 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.27 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30 
 
 
472 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  28.4 
 
 
510 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.4 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.48 
 
 
453 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  27.91 
 
 
452 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  25.41 
 
 
372 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  32.2 
 
 
476 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  28.8 
 
 
485 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  34.11 
 
 
369 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
412 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  34.11 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
445 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.63 
 
 
441 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  26.42 
 
 
455 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  28.16 
 
 
515 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  29.6 
 
 
492 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
462 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>