More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1247 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  100 
 
 
651 aa  1304    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  68.29 
 
 
630 aa  852    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  67.66 
 
 
630 aa  852    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  68.45 
 
 
630 aa  850    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  65.63 
 
 
634 aa  828    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  46.18 
 
 
602 aa  545  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  43.31 
 
 
605 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  42.81 
 
 
633 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  43.23 
 
 
631 aa  502  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  43.72 
 
 
629 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  43.69 
 
 
618 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  44.76 
 
 
640 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  42.81 
 
 
633 aa  502  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  42.4 
 
 
625 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  41.96 
 
 
597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  36.76 
 
 
658 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  37.77 
 
 
631 aa  428  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  36.21 
 
 
655 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  37.6 
 
 
642 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  42.14 
 
 
530 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  38.72 
 
 
518 aa  359  7e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  39.59 
 
 
517 aa  359  7e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  38.83 
 
 
506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  39.74 
 
 
520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  42.56 
 
 
510 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  32.4 
 
 
671 aa  351  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  37.52 
 
 
521 aa  348  2e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  38.23 
 
 
519 aa  343  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.9 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
469 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.48 
 
 
412 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.71 
 
 
473 aa  61.6  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
454 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
454 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  31.25 
 
 
455 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
454 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  31.25 
 
 
455 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  31.25 
 
 
455 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.46 
 
 
453 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  26.52 
 
 
423 aa  60.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
416 aa  60.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
466 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  31.54 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
467 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
454 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
462 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  31.25 
 
 
455 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
492 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  27.71 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  26.37 
 
 
444 aa  58.9  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  26.37 
 
 
444 aa  58.9  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.18 
 
 
463 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  29.83 
 
 
404 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
455 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.78 
 
 
451 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.18 
 
 
441 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
472 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
455 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
472 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  32.31 
 
 
560 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
442 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.6 
 
 
428 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.6 
 
 
428 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
428 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
474 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
468 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
459 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  32.31 
 
 
608 aa  57.4  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.02 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30 
 
 
476 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.1 
 
 
423 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  29.41 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  28.47 
 
 
482 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30.83 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
467 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
485 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
460 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  30.83 
 
 
520 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  30.83 
 
 
521 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  28.91 
 
 
449 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
469 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  30.83 
 
 
523 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
445 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  26.29 
 
 
498 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  30.83 
 
 
523 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
485 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
483 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  30.83 
 
 
520 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  30.83 
 
 
520 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  29.31 
 
 
440 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
478 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  27.33 
 
 
438 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  24.02 
 
 
508 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32.56 
 
 
563 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>