More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1688 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1688  response regulator receiver protein  100 
 
 		 385 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 864 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 867 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 909 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 999 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 519 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 866 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 954 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 900 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 539 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 1084 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  56.25 
 
 		 884 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  42.03 
 
 		 516 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  43.94 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 188 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 153 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 781 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 241 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 541 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 201 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  43.08 
 
 		 1006 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  37.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 993 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 226 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 920 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 226 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 928 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  41.1 
 
 		 574 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 524 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 229 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 221 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 197 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.62 
 
 		 221 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.19 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 216 aa  49.7  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 983 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 913 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  38.1 
 
 		 887 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 862 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 592 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 992 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 119 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 937 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 981 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  31.13 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.06 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  37.08 
 
 		 963 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 959 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.21 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 567 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  46.88 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 1013 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 91 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  39.34 
 
 		 92 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  44.44 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  42.62 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 216 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 92 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6637  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  39.34 
 
 		 92 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 209 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>