200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3744 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 345 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  41.59 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.54 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  30 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  24.7 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  24.35 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.09 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0813  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  21.31 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  22.95 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  28.38 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.41 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4360  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00124658  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  25.69 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  25.57 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2544  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.41 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66454  normal  0.363997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.02 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  19.94 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  23.81 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  22.69 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  22.1 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2141  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.01 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0815  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.01 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  23.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4469  twin-arginine translocation pathway signal  20 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.355969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.6 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  24.42 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.61 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  21.52 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  21.52 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1958  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2372  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.7 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.45 
 
 		 372 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  20.27 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.18 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.24 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.24 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.24 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0644011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>