More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4043 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
348 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  79.6 
 
 
348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  75.29 
 
 
347 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  44.72 
 
 
349 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 
346 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  33.12 
 
 
346 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  32.69 
 
 
347 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
374 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.83 
 
 
348 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
350 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
342 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
347 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 
348 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 
358 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
348 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.86 
 
 
383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  31.44 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
355 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  31.82 
 
 
342 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  30.18 
 
 
348 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
347 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  33.03 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
355 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
407 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  27.84 
 
 
344 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  27.83 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
350 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  29.91 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.31 
 
 
378 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
355 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
355 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.7 
 
 
354 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  28.36 
 
 
354 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  26.54 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.14 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  28.9 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  31.32 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
353 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  27.36 
 
 
347 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2054  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.8 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.03 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  26.1 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  26.65 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.81 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.09 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  23.81 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.37 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.34 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.81 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.81 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.81 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.54 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.01 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.49 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  25.43 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  29.37 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>