279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0752 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
374 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  79.63 
 
 
358 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  77.09 
 
 
355 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  72.7 
 
 
355 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  62.83 
 
 
350 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  65.85 
 
 
348 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  62.57 
 
 
350 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  60.29 
 
 
355 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  62.31 
 
 
347 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  58.08 
 
 
348 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  58.08 
 
 
348 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  57.82 
 
 
348 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  59.02 
 
 
348 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  54.93 
 
 
350 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  58.31 
 
 
348 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  58.01 
 
 
348 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.08 
 
 
348 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
342 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
347 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  38.4 
 
 
342 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  39.09 
 
 
335 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.38 
 
 
383 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  36.12 
 
 
407 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
354 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 
362 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
347 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 
355 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 
345 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  36.26 
 
 
344 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
348 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  31.07 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.63 
 
 
349 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
343 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.98 
 
 
344 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
355 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  25.45 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  25.15 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.49 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.93 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.92 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.05 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.37 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  25.52 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26.33 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.33 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.72 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  23.82 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.06 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.24 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  23.03 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  25.67 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2054  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.92 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.12 
 
 
344 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
326 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.27 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.75 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  22.51 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.45 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.75 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.17 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>