More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2054 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  96.94 
 
 
360 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  97.02 
 
 
336 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  96.94 
 
 
360 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  96.94 
 
 
360 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2054  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
360 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  96.94 
 
 
360 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  96.67 
 
 
360 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  96.94 
 
 
360 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  82.64 
 
 
362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  83.48 
 
 
362 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  84.3 
 
 
363 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  82.32 
 
 
362 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  84.66 
 
 
363 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  84.66 
 
 
363 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  84.38 
 
 
363 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  82.63 
 
 
365 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1875  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  79.06 
 
 
363 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217985  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  83.38 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 
345 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  42.15 
 
 
350 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  41.39 
 
 
347 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2124  extracellular solute-binding protein family 1  40.45 
 
 
400 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2099  extracellular solute-binding protein family 1  40.27 
 
 
343 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.603993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0468  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  36.23 
 
 
337 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0470  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  35.33 
 
 
337 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  36.23 
 
 
337 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0531  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  35.93 
 
 
337 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0476  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  35.93 
 
 
337 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.547307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.18 
 
 
325 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
362 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.15 
 
 
349 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  26.88 
 
 
340 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.01 
 
 
360 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.51 
 
 
341 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.51 
 
 
341 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
343 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 
348 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  30.88 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.36 
 
 
844 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
333 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.47 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.96 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.92 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
361 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  28.86 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
365 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
365 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  27.33 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
343 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
341 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  30.89 
 
 
337 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.45 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.15 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.45 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.15 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.15 
 
 
341 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.34 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  27.12 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  28.28 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.83 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.92 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  28.12 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2521  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  25.5 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>