More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1248 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
347 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  78.16 
 
 
348 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  75.29 
 
 
348 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  44.79 
 
 
349 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  33.74 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  32.57 
 
 
346 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  32.37 
 
 
335 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 
346 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
347 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
338 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 
347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.62 
 
 
383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
355 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
343 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  30.88 
 
 
344 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  30.59 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.08 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
354 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 
348 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
350 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
345 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  28.7 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  31.71 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
348 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  27.87 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
407 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  29.14 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
355 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
340 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.07 
 
 
354 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
340 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  28.14 
 
 
347 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
346 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
347 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  29.48 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.62 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
363 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  26.8 
 
 
348 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  27.65 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.72 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
365 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
365 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.97 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.73 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.99 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
364 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.97 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.17 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.66 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  26.62 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  26.13 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.08 
 
 
844 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  25.32 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.87 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.61 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.43 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.71 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2054  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.56 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  28.12 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  26.56 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  26.43 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>