More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7049 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
354 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  84.23 
 
 
383 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  89.41 
 
 
355 aa  614  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  87.04 
 
 
362 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  70.45 
 
 
407 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  56.47 
 
 
347 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 
342 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  50.29 
 
 
347 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  49.85 
 
 
335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  47.01 
 
 
342 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  43.82 
 
 
344 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  37.96 
 
 
350 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 
350 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 
347 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
348 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
348 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 
358 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  39.88 
 
 
348 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 
348 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
374 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  38.82 
 
 
348 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
350 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.25 
 
 
348 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 
348 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 
348 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  31.09 
 
 
348 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
347 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
345 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  31.29 
 
 
345 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.96 
 
 
349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
358 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 
347 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  30.93 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
340 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  29.02 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
346 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  28.84 
 
 
323 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
338 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.91 
 
 
354 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
345 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
348 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
343 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  27.67 
 
 
344 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
355 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
340 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  27.78 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.99 
 
 
354 aa  85.9  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.92 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.55 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.11 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.02 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4469  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.355969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  25.32 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.72 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.24 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.24 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.54 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.24 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.24 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.24 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.24 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.28 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.28 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.84 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.08 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>