More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5064 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  95.43 
 
 
348 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  95.43 
 
 
348 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
350 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  96.29 
 
 
348 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  96 
 
 
348 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  90.85 
 
 
348 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  90.55 
 
 
348 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  86 
 
 
348 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  61.73 
 
 
358 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  62.27 
 
 
355 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  61.66 
 
 
355 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  61.54 
 
 
348 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  62.85 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  56.41 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 
350 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  54.26 
 
 
350 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  56.5 
 
 
347 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.64 
 
 
383 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 
354 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  39.56 
 
 
355 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  38.46 
 
 
407 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  39.35 
 
 
335 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 
347 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  36.92 
 
 
342 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 
347 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  37.64 
 
 
345 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  38.22 
 
 
344 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
348 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
347 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  31.55 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  30.82 
 
 
348 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  27.79 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
338 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  28.06 
 
 
345 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.98 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  26.67 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.24 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.89 
 
 
323 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.95 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  27.8 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.46 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.62 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  23.65 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  24.2 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.39 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.12 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.64 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.84 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.84 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.24 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  23.1 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.22 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.85 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.22 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.04 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.16 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.91 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.52 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.88 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  27.04 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.48 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.93 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.93 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>