More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1897 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 355 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  92.39 
 
 		 383 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  84.51 
 
 		 354 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  83.02 
 
 		 362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  71.23 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  57.02 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  53.29 
 
 		 342 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  49.86 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  48.81 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  45.05 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  48.06 
 
 		 345 aa  315  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  44.48 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  39.29 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  40.19 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.56 
 
 		 348 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  36.5 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  31.37 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.83 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.75 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  26.73 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  24.72 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  26.87 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.36 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.61 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.68 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  26.65 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4469  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.355969 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.36 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  23.01 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.49 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  24.76 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  23.71 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.51 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.27 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.71 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.71 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.71 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.71 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.71 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.71 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.14 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>