More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4156 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
358 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  48.36 
 
 
347 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  48.36 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  43.12 
 
 
323 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  36.6 
 
 
344 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
354 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
347 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.88 
 
 
383 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
362 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
345 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  24.78 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.3 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
407 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
344 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
346 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  27.48 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
344 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  25.71 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  26.73 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  25.58 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.83 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.08 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  28.53 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.56 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  25.07 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  25.57 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  25.07 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4469  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.355969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  27.01 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  26.19 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  25 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  24.92 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6274  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283816  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.74 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  27.56 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.35 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.38 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.33 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.14 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.11 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  24.51 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
351 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  23.97 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  23.97 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.56 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  24.77 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  23.03 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.56 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.18 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  27.43 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 
364 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  24.18 
 
 
345 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>