218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4433 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
355 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  71.69 
 
 
348 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  68.62 
 
 
358 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  68.5 
 
 
355 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  68.31 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  60.29 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  59.65 
 
 
350 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  58.29 
 
 
350 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  62.2 
 
 
348 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  62.2 
 
 
348 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  62.88 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  62.8 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  62.88 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  61.75 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.59 
 
 
348 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 
348 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  54.91 
 
 
347 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 
342 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
347 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  40.12 
 
 
335 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  36.87 
 
 
354 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  38.73 
 
 
342 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  36.9 
 
 
407 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.34 
 
 
383 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
347 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
345 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 
355 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
362 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  38.46 
 
 
344 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
347 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  28.53 
 
 
348 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
348 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.76 
 
 
349 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
343 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
338 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  27.56 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.74 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  26.72 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.95 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26.6 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  26.27 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.14 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.51 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.87 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.17 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26.97 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.54 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.68 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.49 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.95 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.54 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.95 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.6 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.78 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.6 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  24.04 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.96 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.86 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.96 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  22.96 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.47 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.65 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  26.24 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.24 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.24 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.24 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  26.24 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.92 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.92 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>