More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1761 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  88.89 
 
 
342 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
341 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  82.7 
 
 
341 aa  590  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  82.99 
 
 
341 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  84.47 
 
 
342 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  72.43 
 
 
342 aa  524  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  54.97 
 
 
340 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  61.08 
 
 
343 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  51.51 
 
 
337 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  50.44 
 
 
343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  49.85 
 
 
343 aa  332  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  49.4 
 
 
343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  48.82 
 
 
344 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  47.08 
 
 
340 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  50.16 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  47.65 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  48.35 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  46.71 
 
 
347 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  46.57 
 
 
344 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  47.42 
 
 
340 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  43.87 
 
 
342 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  44.14 
 
 
343 aa  286  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  43.73 
 
 
342 aa  243  5e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  35.65 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  42.49 
 
 
266 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  33.56 
 
 
379 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
335 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
343 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  33.55 
 
 
339 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
340 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 
339 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
345 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  33.74 
 
 
346 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.74 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  34.65 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.44 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.44 
 
 
358 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.95 
 
 
341 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.95 
 
 
341 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.93 
 
 
347 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
356 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  31.21 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.65 
 
 
347 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 
340 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.35 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.34 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.01 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.07 
 
 
336 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
340 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  28.07 
 
 
336 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 
339 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.02 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  32.95 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
341 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  32.57 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.71 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  32.17 
 
 
344 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  32.56 
 
 
344 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  29.61 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  32.17 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.28 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  32.17 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  32.17 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  31.8 
 
 
344 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  31.8 
 
 
344 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.95 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 
296 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  31.01 
 
 
344 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
341 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
368 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  28.85 
 
 
344 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
342 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.02 
 
 
341 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  28.01 
 
 
331 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.02 
 
 
341 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.67 
 
 
341 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.95 
 
 
325 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.67 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.93 
 
 
339 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
327 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  28.93 
 
 
339 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.81 
 
 
341 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 
334 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
470 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  26.81 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>