More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4317 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 343 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  61.34 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  64.15 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.78 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.78 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  60.29 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  59.05 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  57.61 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  55.03 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  53.53 
 
 		 340 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  51.85 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  48.81 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  48.82 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  49.53 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  48.52 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  47.63 
 
 		 344 aa  321  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  47.45 
 
 		 346 aa  318  6e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  48.74 
 
 		 343 aa  318  9e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  45.48 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  45.29 
 
 		 342 aa  295  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  42.81 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  38.34 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  41.39 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  35.05 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  35.54 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  35.54 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  34.11 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  33.02 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.02 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.09 
 
 		 358 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.7 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.7 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.72 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.68 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.43 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  32.54 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.95 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.03 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  31.02 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  30.7 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  26.61 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.26 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  32.96 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.38 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.38 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  32.22 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.31 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  32.22 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  30.85 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  28.73 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.61 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.45 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  27.7 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.71 
 
 		 844 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.72 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>