More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1945 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  100 
 
 
345 aa  698    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2139  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 
347 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  37.09 
 
 
334 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0923  extracellular solute-binding protein family 1  34.12 
 
 
347 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2404  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  27.84 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0209  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  30.11 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0215  hypothetical protein  30.11 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
333 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
327 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.03 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
347 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 
344 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  28.96 
 
 
346 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.35 
 
 
343 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  27.85 
 
 
364 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 
344 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.99 
 
 
344 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 
343 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
340 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.61 
 
 
343 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
343 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
343 aa  99.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.84 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.84 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.55 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.84 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
343 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.55 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.93 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.17 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
378 aa  94  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
340 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
341 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.95 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.17 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.08 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.83 
 
 
341 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.6 
 
 
341 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
340 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.22 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.42 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.19 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  26.25 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.08 
 
 
358 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
333 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.64 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1875  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.64 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217985  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  27.98 
 
 
362 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.89 
 
 
334 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.12 
 
 
325 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.96 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  27.74 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.01 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.48 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  29.95 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.74 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.09 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>