More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3495 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 375 aa  768    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 470 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4655  putative regulatory lipoprotein  30.77 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  29.93 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  29.21 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 511 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 516 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  27.99 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  26.88 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2139  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.32 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.32 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.32 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.32 
 
 		 436 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  27.54 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.29 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  26.16 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.16 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.76 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  26.74 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  28.25 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  26.36 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3615  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  26.06 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0923  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  24.53 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.9 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.19 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.7 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.86 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  25.29 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  23.71 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  29.12 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.86 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.61 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  24.83 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  25.1 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.32 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04830  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  28.02 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.32 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  24.32 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.61 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>