More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04830  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  100 
 
 
359 aa  718    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
327 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  25.08 
 
 
346 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
343 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  24.37 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.63 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.57 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  25.16 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
343 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28050  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.2 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.2 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.53 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  24.53 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.23 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  24.26 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  24.81 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  25.57 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.78 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  21.9 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  25.95 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  25.95 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4039  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  25.57 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  25.57 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  25.57 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3833  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  25.57 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.17 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.69 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  24.69 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.69 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2521  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  25.54 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  28.84 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  24.31 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1875  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.38 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217985  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  25.19 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  22.78 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  22.18 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2404  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  22.68 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  24 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  24.07 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  24 
 
 
362 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  24.85 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.51 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.89 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  23.88 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.66 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.66 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2139  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.56 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.89 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>