40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3615 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3615  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 572 aa  1150    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  31.51 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 442 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.36 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.7 
 
 		 338 aa  50.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.93 
 
 		 347 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 342 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  30.99 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  27.04 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  37.7 
 
 		 350 aa  48.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 355 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  36.21 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  26.5 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 347 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.15 
 
 		 341 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 350 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  21.96 
 
 		 364 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04830  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.19 
 
 		 359 aa  44.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.88 
 
 		 333 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.37 
 
 		 341 aa  43.9  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.37 
 
 		 341 aa  44.3  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 343 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.15 
 
 		 341 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 322 aa  43.9  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  38.33 
 
 		 350 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>